En pleine mer, Kelvin et son père sont attaqués par un monstre. Secouru par le KRB, un groupe de chercheurs oeuvrant dans une base sous-marine, le jeune homme intègre l'organisation dans l'espoir de retrouver son père. Poursuivi par une secte à la recherche de galets aux pouvoirs mystérieux, il parcourt les océans pour les rassembler et calmer la colère de Cube-thulu.